Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NeblQ0II04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NeblQ0II04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms