Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pate4Q09098 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pate4Q09098 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pate4Q09098 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms