Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
MestQ07646 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MestQ07646 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MestQ07646 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MestQ07646 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MestQ07646 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MestQ07646 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MestQ07646 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MestQ07646 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MestQ07646 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MestQ07646 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MestQ07646 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MestQ07646 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MestQ07646 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MestQ07646 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MestQ07646 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MestQ07646 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MestQ07646 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MestQ07646 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MestQ07646 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MestQ07646 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MestQ07646 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MestQ07646 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms