Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gdf9Q07105 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Gdf9Q07105 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms