Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pfdn6Q03958 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pfdn6Q03958 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms