Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pax5Q02650 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pax5Q02650 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms