Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa1Q00623 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa1Q00623 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoa1Q00623 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms