Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Psme1P97371 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psme1P97371 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme1P97371 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Psme1P97371 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psme1P97371 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Psme1P97371 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Psme1P97371 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme1P97371 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme1P97371 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psme1P97371 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms