Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl27P61358 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl27P61358 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms