Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube2mP61082 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ube2mP61082 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.7 ms