Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snap25P60879 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap25P60879 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap25P60879 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snap25P60879 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snap25P60879 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snap25P60879 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms