Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Samsn1P57725 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samsn1P57725 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Samsn1P57725 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms