Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NrlP54846 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NrlP54846 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NrlP54846 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NrlP54846 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NrlP54846 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NrlP54846 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NrlP54846 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NrlP54846 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NrlP54846 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NrlP54846 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NrlP54846 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NrlP54846 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NrlP54846 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NrlP54846 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NrlP54846 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NrlP54846 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NrlP54846 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NrlP54846 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NrlP54846 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NrlP54846 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NrlP54846 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NrlP54846 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NrlP54846 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NrlP54846 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NrlP54846 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NrlP54846 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NrlP54846 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NrlP54846 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NrlP54846 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NrlP54846 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NrlP54846 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NrlP54846 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NrlP54846 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NrlP54846 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms