Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Atoh1P48985 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atoh1P48985 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atoh1P48985 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms