Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nedd4P46935 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nedd4P46935 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nedd4P46935 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms