Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkn1bP46414 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms