Protein–RNA interactions for Protein: P43137

Reg1, Lithostathine-1, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg1P43137 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Reg1P43137 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reg1P43137 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Reg1P43137 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Reg1P43137 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms