Protein–RNA interactions for Protein: P41272

Cd27, CD27 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd27P41272 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd27P41272 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd27P41272 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd27P41272 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd27P41272 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd27P41272 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms