Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kdm5cP41230 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5cP41230 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5cP41230 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5cP41230 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms