Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fen1P39749 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fen1P39749 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fen1P39749 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fen1P39749 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms