Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ly6dP35459 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ly6dP35459 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ly6dP35459 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms