Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ptpn11P35235 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ptpn11P35235 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ptpn11P35235 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms