Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxa10P31310 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxa10P31310 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxa10P31310 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms