Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kif3aP28741 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kif3aP28741 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kif3aP28741 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms