Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept4P28661 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sept4P28661 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sept4P28661 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sept4P28661 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms