Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf239P24399 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf239P24399 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf239P24399 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf239P24399 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf239P24399 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms