Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcna3P16390 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcna3P16390 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcna3P16390 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna3P16390 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcna3P16390 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms