Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd5P13379 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd5P13379 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms