Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chrm1P12657 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Chrm1P12657 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms