Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FlgP11088 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FlgP11088 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FlgP11088 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FlgP11088 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FlgP11088 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FlgP11088 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FlgP11088 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FlgP11088 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FlgP11088 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FlgP11088 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FlgP11088 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FlgP11088 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FlgP11088 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FlgP11088 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FlgP11088 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FlgP11088 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FlgP11088 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FlgP11088 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FlgP11088 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FlgP11088 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FlgP11088 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FlgP11088 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FlgP11088 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FlgP11088 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FlgP11088 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FlgP11088 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FlgP11088 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FlgP11088 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FlgP11088 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FlgP11088 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FlgP11088 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FlgP11088 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FlgP11088 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FlgP11088 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FlgP11088 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FlgP11088 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FlgP11088 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FlgP11088 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FlgP11088 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FlgP11088 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FlgP11088 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FlgP11088 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.3 ms