Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prf1P10820 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prf1P10820 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms