Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Prm2P07978 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Prm2P07978 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms