Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fgf3P05524 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fgf3P05524 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fgf3P05524 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms