Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01746 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01746 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01746 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01746 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01746 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01746 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01746 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01746 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01746 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01746 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01746 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01746 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01746 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01746 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01746 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01746 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01746 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01746 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01746 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01746 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01746 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01746 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01746 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01746 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01746 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01746 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01746 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01746 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01746 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01746 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01746 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01746 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01746 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01746 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01746 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01746 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01746 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01746 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01746 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01746 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
P01746 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms