Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stx8O88983 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stx8O88983 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stx8O88983 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx8O88983 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms