Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Parp2O88554 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Parp2O88554 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp2O88554 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Parp2O88554 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Parp2O88554 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp2O88554 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Parp2O88554 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms