Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vamp4O70480 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vamp4O70480 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms