Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cer1O55233 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cer1O55233 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cer1O55233 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cer1O55233 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cer1O55233 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cer1O55233 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cer1O55233 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cer1O55233 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cer1O55233 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cer1O55233 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cer1O55233 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cer1O55233 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cer1O55233 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cer1O55233 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cer1O55233 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms