Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Gp1baO35930 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gp1baO35930 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms