Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf5O35445 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms