Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgisO35074 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgisO35074 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtgisO35074 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtgisO35074 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms