Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Flot1O08917 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Flot1O08917 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Flot1O08917 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms