Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IfnabL7MTU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IfnabL7MTU6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IfnabL7MTU6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms