Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Mfsd4b4J3QNS5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Mfsd4b4J3QNS5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms