Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
4930544D05RikJ3QK56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930544D05RikJ3QK56 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms