Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34c3J3QJW5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34c3J3QJW5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34c3J3QJW5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34c3J3QJW5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms