Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cacna1iE9Q7P2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna1iE9Q7P2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms