Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms