Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
2610021A01RikE9Q0Q3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms