Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm20425E9Q035 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20425E9Q035 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20425E9Q035 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms